对于我们普通农民，也许不了解什么是种质资源，也更不知它的重要性。而对于农业部门、农业研究者来说，对于种质资源的管理是非常重要的工作。作物种质资源是生物资源的重要组成部分，是培育作物优质、高产、抗病，抗逆新品种的物质基础，同时也是提高农业综合生产能力，维系国家食物安全的重要保证，因此，使用种质资源管理系统对种质资源进行管理意义重大。但是在农业生产过程中，所使用的种质资源有遗传基础日益贫乏的趋势，这是为什么呢？
1、在育种过程中，人们总是按照一定的目标，沿着一定的方法进行选择，选择的时间越长，其强度也就越大，品种的遗传基础也就越窄。
2、经种质资源管理系统的研究我们发现，新品种的不断育成和推广，使原有老品种特别是地方品种逐渐被淘汰，并且还没有作为种质保存下来，这样就导致许多有益的基因随之丢失。
3、杂交育种中使用的亲本，越来越集中到对当地条件最能适应、综合性状最好、配合力最佳的少数几个品种上，这样也会导致众多品种之间的亲缘相近。
4、随着农田基础建设规模的扩大和耕作栽培制度的改革，农田生态环境条件的差异日益缩小，这样会导致许多作物的多样性变异失去了生存条件。另外再加上水库、工厂、道路等设施对农业生态环境的破坏，还使一些野生种失去了适宜的生存环境而濒临绝灭，由于以上的种种原因，使种质资源管理系统对种质资源搜集和保存工作变得日益重要。
