转基因测试纸法与ELISA法相比，应用试纸条检测蛋白也是根据抗原抗体特异性结合的原理，不同之处之一是以硝化纤维代替聚苯乙烯反应板为固相载体。纸条方法是一种快速简便的定性检测方法，将试纸条放在待测样品抽提物中，5-10分钟就可得出结果，不需要特殊仪器和熟练技能。
转基因测试纸测定法是先将特异性抗体吸附在膜上，将膜蘸入样品溶液，蛋白质随着液相扩散，遇到抗体，发生抗原-抗体反应，通过阴性对照筛选阳性结果，给出转基因成分含量的大致范围。此方法操作简单，费用低，耗时少。但一种试纸条只能检测一种蛋白质，不能区分具体的转基因品系，且检测灵敏度低。
ELISA法是一种利用免疫学原理检测 抗原、抗体的技术.由于酶的放大作用，使测定的灵敏度极高，可检测出1pg的目的物，同时酶反应还具有很强的特异性。除了可溶性抗原(抗体)之外，ELISA还可以检测含表面抗原的细胞。该方法已用于辣椒、水稻、烟草、番茄等转化植株的鉴定工作中。ELISA的检测虽然很灵敏，但容易出现本底过高的问题，应予以充分的注意。
转基因测试纸法与ELISA法的区别就在以上方面，如进行转基因检测，还需根据实际要求来选择最合适的产品，以保证测试的标准性！
