种质资源管理系统是种质资源库的配套软件，主要用于种质资源管理。该系统可通过条形码或电子标签为种子建立唯一标识，实现育种资源的动态出入库管理和预警提醒、远程查询检索等。
种质资源管理系统的应用为农作物的育种工作提供了更多的保障，对作物品种的选育而言有着十分高的应用价值，大大的提高了种质资源的实际利用率，促进培育突破性品种的进程，使资源数据管理更加科学化、规范化。种质资源管理系统数据信息类型主要包括基础数据信息、管理数据信息、鉴定和评价数据信息、交换数据信息等。基础数据信息包括登记材料数据和搜集数据两大部分内容。管理数据信息是中长期库进行种质资源材料登记、保存管理以及进行繁殖更新后不可缺少的信息。鉴定和评价数据包括鉴定、原始和进一步评价数据，即各供种机构的鉴定评价数据。交换数据信息主要包括交换目录内有关种质引进和分发的数据。
目前有很多种子公司，包括大型种业企业，在育种数据的管理、汇总、分析、利用上有明显的不足和落后，育种信息化是很多大型种业企业急需解决的课题。没有先进的种质资源库管理系统软件，就实现不了现代商业育种。该系统的“诞生”，实现了育种材料编码条码化，田间数据调查无纸化、高效采集；育种材料世代追踪，系谱图直观体现；种质库管理，提供育种材料库存动态管理，领用记录，育种图文资料存档及种质系谱溯源信息；支持自交系材料选育管理及杂交材料管理，玉米品种、自交系材料分析；多年多点多材料文本数据，照片集中管理；玉米科研育种专用，通过终端可同时在线联网使用，育种团队成员间在有权限情况下可实现数据共享，这也正是该系统研发的价值所在。
