现代农业生产中，用到米质判定仪的地方越来越多。其中就有育种专家利用它分析研究，并培育出了良好特性的品种。过去，在粮食危机和人们生活水平日益增长的双重压力下，培育高产优质超级水稻新品种成了育种专家长期奋斗目标，但那时并没有像米质判定仪提供技术在支撑，传统育种变得缓慢。如今，随着农业信息化的不断发展，很多种子检验仪器被人们所认识。
通过米质判定仪，研究人员以高产但综合品质差的品种“特青”作为受体，以蒸煮和外观品质具有良好特性的品种“日本晴”和“93-11”为供体，对涉及水稻产量、稻米外观品质、蒸煮食味品质和生态适应性的28个目标基因进行优化组合。这些优异的“品种设计”材料，在高产的基础上，稻米外观品质、蒸煮食味品质、口感和风味都有了很大程度的提升，并且与其配组的杂交稻稻米品质也有了明显改良。此项研究结果必将掀起作物传统育种向高效、精准、定向的分子设计育种转变的狂潮。这也进一步证明了米质判定仪在育种工作中的重要应用。
因为大米外观是最直观的大米特征，从大米的外观上也常常能够看出大米内在的一些变化，所以将大米外观列为大米品质检测的一项重要内容是有科学道理的，应用米质判定仪，就能有效避免垩白率、碎米率高，含有未熟粒、病斑粒和霉变粒的大米流向市场，保证消费者健康。
