根系扫描仪是托普云农推出的一种现代植物生理仪器，这款仪器主要用于洗根后的根系图像分析。是现代根系研究中常用的仪器设备之一。我们知道根系是植物的重要器官，根系的状态不仅仅影响着土壤水分养分的吸收，还会对植物生长产生较大的影响，严重的还会导致作物死亡。因此根系研究观察也是现代农业研究中的一个重要方向。而托普云农的根系扫描仪就是一款专业针对的根系研究的仪器。
托普云农的根系分析仪可分析根系的长度、直径、面积、体积、根尖数、分叉数、根交叉数等。专业些的根系分析系统，还可分析植物根系的主侧根拓扑形态关系、连接关系，以及根尖部位的色彩变化，以便进行根系形态和构造研究。同时根系分析系统具备图像全自动分析特性，用户可对自动分析结果进行局部的交互编辑修正，以确保数据的科学性。对原位根系图像，因根系与土壤的颜色可能非常接近，故国内外均采用图像中根系目标的自动增强后，以交互引导的方式进行标记分析。因此在现代根系分析工作中通常都是使用根系扫描仪来进行分析的。例如通过该根系扫描仪研究水稻根系特点。
水稻属于须根系，有种根和不定根之别。种根又称初生根，只有一条，由胚根直接发育而成，在幼苗期营养吸收作用，以后枯死。不定根又称永久根，由茎基部的茎节上生出，其上再发生支根。陆稻、早播稻湿润管理时，嫩根伸长至上表皮细胞外壁延伸出多量根毛，但在水层中生长的水稻不长根毛或根毛极少。
且根的顶端有生长点，外有帽状根冠保护。根的数量、长度、分布、伸展角度等因环境条件而变化。根的横剖面由中柱、皮层和表皮三部分构成，中柱内有木质部的大导管十余个,成辐射状排列，韧皮部与后生木质部相间排列。皮层细胞间隙扩大呈空洞，形成裂生通气组织，以进行气体的输送。
